研究联合体作为企业合作研发的有效载体，可以提高企业创新效率，降低创新投资风险，促进我国企业自主创新能力的提升。开放式创新通过全球创新资源在创新主体间流动，可放大创新资源的价值，实现创新活动的不断深化。因此，开放式创新成为研究联合体合作研发的必然选择。然而，研究联合体的成功率并不高，运行机制的低效是制约其快速发展的瓶颈。基于此，构建了开放式创新下的研究联合体运行机制框架，并对运行机制包含的8个方面进行了深入系统的分析。研究发现，只有各机制相互联系、相互作用，才能实现研究联合体运行机制的稳定，并发挥研究联合体的竞争优势。