我国国家高新区经过20多年的成长，经历了较快的经济增长和规模扩张，部分高新区出现功能异化、偏离其预设功能目标等现象。在此背景下，2006年温家宝总理提出国家高新区“四位一体”的目标定位，国家高新区开始“二次创业”的规划和转型，形成内生创新型产业集群模式。该内生创新型发展模式是否是可持续的，如何在自然、经济、社会的协调发展背景下实现高新区的可持续发展？对该问题的探索必须跳出经济系统研究的理论框架，以生态系统为研究对象，将资源、环境、自然生态视为系统的构成要素，构建高新区生态系统及其演进模型，探讨科技新城生态系统的理想结构，甚至更高级阶段的系统结构，进一步优化系统演化的催化条件和作用机制，以此引导、推进高新区生态系统的持续演化和阶段性演替。